特殊樣本蛋白組學之FFPE樣本

時間:2019-12-05

福爾馬林固定石蠟包埋(Formalin Fixed Paraffin Embedded,FFPE)是目前病理科普遍采用的組織處理和保存方法,組織標本經取材、固定、脫水、透明、浸蠟以及包埋等程序處理之后可長時間保存。
FFPE組織操作簡單,易于掌握且成本較低,因此FFPE組織已廣泛應用于病理科的常規病理臨床工作中。盡管其具如此多優勢,但作為科研的樣本(較新鮮樣本)劣勢也非常明顯。文獻中關于FFPE蛋白組學的研究越來越多,但由于FFPE組織樣本含有共價蛋白交聯、低蛋白溶解率以及比較低的肽段回收率,也是目前公認的對FFPE樣本研究的瓶頸。
別慌,青蓮資深的實驗技術人員有豐富的FFPE樣本處理經驗,可以盡可能使FFPE樣本的蛋白信息最大化~

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【產品背景】

蛋白質組學研究材料主要是新鮮的組織、體液或體外培養細胞,新鮮標本可以最大限度保存蛋白質的結構完整性。醫學發展的趨勢是對疾病的微創傷性進行早期診斷,以新鮮組織為樣本進行大批量系統性的研究變得越來越困難。世界各大醫院及研究機構都有極其豐富的病變組織檔案庫,即甲醛固定及石蠟包埋的組織庫,這些組織具有病史清楚、診斷明確、臨床資料詳盡等優點,并能長期穩定室溫保存,對疾病的回顧性研究(尤其是罕見病例)具有極高的應用價值。
因此,目前很多研究人員對臨床疾病的FFPE樣本進行蛋白組學研究,尋找生物標志物、藥物靶點,進而深入研究機理。


【技術原理】

FFPE樣本的蛋白組學與我們普通樣本的蛋白組學原理相同(二級譜圖用來定性;Label-free為一級圖譜,iTRAQ/TMT為二級譜圖定量),區別就是在樣本前處理的不同。


【項目流程】

【樣本要求】

FFPE切片(白片)3片/樣本;20mg組織/樣本。


結果展示

(全局分析,差異蛋白火山圖,聚類熱圖,GO分析,KEGG分析,PPI分析)


【項目周期】

質檢合格后,40個工作日(具體視樣本量多少決定)。

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